La Autoridad Portuaria de Ferrol-San Cibrao ha superado la auditoría de la Norma UNE EN ISO 14001:2004 "Sistemas de Gestión Ambiental", renovando este certificado de calidad que tiene desde enero del 2012, y que deberá volver a someterse a examen antes del 2018. Este sistema,-certificado por Bureau Veritas, se aplica en la gestión de uso de dominio público portuario (Concesiones, autorizaciones y licencias) y en la Infraestructura e inversión portuaria. También comprende la Gestión directa de servicios portuarios como la Señalización marítima, la Escala de buques y embarcaciones deportivas, el Tráfico de mercancías y pasajeros, la Seguridad y vigilancia, entre otros, que se encuentran en el ámbito de la APFSC.