La Universidad impartirá el citado Máster, encargándose la gestión administrativa del mismo, y organizará anualmente el "Foro Marítimo Deusto", jornada sobre cuestiones de actualidad en la materia, en la que se concitan los ámbitos profesional y académico relacionados con este sector y que sirve como escaparate de ideas, propuestas y proyectos de futuro a tener en cuenta para su posible desarrollo.
Plan de actuaciones anual
El Departamento de Medio Ambiente y Política Territorial participará en la definición del plan de actuaciones anual colaborando con la Universidad de Deusto en el diseño y desarrollo de los proyectos y actividades de formación e investigación relacionadas con el transporte marítimo y la gestión de empresas marítimo-portuarias. También participará en la financiación de las actuaciones dentro de los límites presupuestarios hasta un límite de 75.000 euros por curso académico de impartición del Master.El Master en Gestión de Empresas Marítimo-Portuarias y Derecho Marítimo se financiará en primera instancia con los ingresos procedentes de las matrículas, que corresponderán en su totalidad a la Universidad de Deusto.En septiembre del año 2000, el Departamento de Vivienda, Obras Públicas y Transportes y la Universidad de Deusto suscribieron un Convenio para la impartición del "Master experto en Gestión de Empresas marítimo portuarias" que ha articulado la relación entre ambas instituciones y el impulso de otros proyectos de interés relacionados con este campo.