El Puerto de Cartagena participa desde hace años, junto con otros puertos europeos, en el proyecto MED PCS (Port Community System). Este proyecto tiene como objetivos generales la mejora del desarrollo de la comunicación entre distintos puertos; la mejora de la competitividad, a través de la actualización de sistemas y desarrollo de protocolos; y el fortalecimiento de la cohesión social y económica, favoreciendo un crecimiento sostenible y unificado dentro del marco de la Unión Europea.
Los socios participantes del proyecto son dentro de España, las Autoridades Portuarias de Tarragona y Cartagena; en Italia participan la Autoridad Portuaria de Levante (conglomerado de tres pequeños puertos entre los que se incluye el de Bari), la Universidad de Nápoles "Federico II" y la Rete Autostrade Mediterranee (gran compañía de transportes tierra-mar); y por parte de Grecia participan el Puerto de Igoumenitsa y la Universidad del Egeo.
Esta iniciativa, que cuenta con un presupuesto de casi dos millones de euros, está cofinanciada con fondos europeos FEDER dentro del programa europeo MED, que tiene como objetivo optimizar la gestión de los puertos y hacerlos más competitivos. En concreto el Puerto de Cartagena dispone de un presupuesto de 300.000 euros, de los cuales el pasado mes de febrero recibió 52.474,76, correspondientes a los fondos solicitados por su participación en el proyecto.
Entre los objetivos que persigue el Puerto de Cartagena con su participación en este proyecto, que se está implementando en varias fases, se incluyen la mejora del control de acceso a muelles; la mejora de la coordinación de actividades en el ámbito portuario; el manejo de manifiestos de carga en contenedores; y actualización del sistema de Dominio Público Portuario.